209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1069 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  854    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  43.2 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  43.2 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  43.2 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  44.14 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  42.46 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  43.39 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  43.39 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  41.96 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  43.39 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  43.39 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  42.89 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  43.14 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  43.64 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  43.64 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  43.64 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  43.39 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  43.39 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  43.73 
 
 		 416 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  44.27 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  43.69 
 
 		 454 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  34.07 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.17 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  28.21 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  28.85 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  30 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.17 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  30.16 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  30.23 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  27.47 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  31.1 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  29.71 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  29.31 
 
 		 422 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  27.64 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  30.57 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  30.22 
 
 		 458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  27.8 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  37.74 
 
 		 212 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  34.15 
 
 		 401 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  28.08 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  29.29 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  27.75 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  27.87 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  28.18 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  30.5 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  38.3 
 
 		 245 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  26.1 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  38.83 
 
 		 245 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  37.5 
 
 		 252 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 460 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  27.15 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  38.66 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  28.16 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  39.52 
 
 		 249 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  28.16 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  26.91 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  38.78 
 
 		 201 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  30.18 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  37.13 
 
 		 206 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 207 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  36.79 
 
 		 207 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  34.78 
 
 		 210 aa  136  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 224 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  37.32 
 
 		 213 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  37.43 
 
 		 207 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  38.86 
 
 		 207 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  34.15 
 
 		 205 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  33.82 
 
 		 205 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  33.82 
 
 		 205 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  38.42 
 
 		 205 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  36.72 
 
 		 213 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  36.63 
 
 		 206 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 		 206 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  32.68 
 
 		 216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  36.19 
 
 		 208 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  35.12 
 
 		 210 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  40.34 
 
 		 247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  37.31 
 
 		 207 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>