207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0531 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  95.92 
 
 		 245 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  84.44 
 
 		 247 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  59.01 
 
 		 208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  52.25 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  51.36 
 
 		 212 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  49.79 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  54.67 
 
 		 449 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  54.98 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  52.89 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  53 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  54.55 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  53 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  53 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  53 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  49.78 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  51.85 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  51.85 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  51.85 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  51.12 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  52.83 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  52 
 
 		 216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  50.22 
 
 		 423 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  48.21 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  49.55 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  54.17 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  49.33 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  49.33 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  48.92 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  52.11 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  47.42 
 
 		 204 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  50.67 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  46.02 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  49.1 
 
 		 212 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  43.11 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  42.86 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  44.81 
 
 		 449 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  45.62 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  42.86 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  51.16 
 
 		 462 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  41.78 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  43.75 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  49.54 
 
 		 460 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  48.33 
 
 		 209 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  42.41 
 
 		 206 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  41.52 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  41.52 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  45.37 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  43.26 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  45.22 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  45.92 
 
 		 464 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  40.95 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  45.6 
 
 		 422 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  43.02 
 
 		 428 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  43.02 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  43.02 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  40.59 
 
 		 401 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  42.7 
 
 		 417 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  42.7 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  43.24 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  43.24 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  42.7 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  43.24 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  43.24 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  43.24 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  42.56 
 
 		 448 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  47.76 
 
 		 413 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  43.09 
 
 		 426 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  42.25 
 
 		 415 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  42.25 
 
 		 415 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 417 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  43.72 
 
 		 458 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  39.64 
 
 		 423 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  45.88 
 
 		 422 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  45.6 
 
 		 380 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  43.09 
 
 		 414 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  42.78 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  36.67 
 
 		 405 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  38.3 
 
 		 417 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  43.09 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  43.09 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  43.09 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  37.6 
 
 		 434 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 426 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 426 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  38.53 
 
 		 489 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  41.85 
 
 		 427 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  34.91 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  41.44 
 
 		 427 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  36.45 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  43.18 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  39.78 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  41.99 
 
 		 427 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>