217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3381 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
220 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
220 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
220 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
220 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  94.74 
 
 
220 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  82.13 
 
 
209 aa  337  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  82.21 
 
 
211 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  82.21 
 
 
211 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  82.21 
 
 
211 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  81.25 
 
 
209 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  81.25 
 
 
209 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  80.68 
 
 
209 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  71.78 
 
 
224 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  73 
 
 
220 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  72.06 
 
 
216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  62.14 
 
 
208 aa  254  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  65.5 
 
 
449 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  56.94 
 
 
449 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  59.9 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  57.35 
 
 
220 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  64.5 
 
 
460 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  55.72 
 
 
423 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  52.83 
 
 
245 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  52.8 
 
 
245 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  56 
 
 
212 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  54.68 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  61.62 
 
 
462 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  55.45 
 
 
215 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  55.5 
 
 
249 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  56.41 
 
 
238 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  50.98 
 
 
216 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  52.22 
 
 
207 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  51.72 
 
 
207 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  51.72 
 
 
207 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  50.51 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  54.59 
 
 
206 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  53.27 
 
 
205 aa  197  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  51.72 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  54.41 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  55.87 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  53.57 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  54.08 
 
 
206 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  52.71 
 
 
207 aa  194  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  47.32 
 
 
209 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  46.8 
 
 
214 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  47.8 
 
 
444 aa  184  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  49.24 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  48.53 
 
 
212 aa  178  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  49.24 
 
 
223 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  45.5 
 
 
426 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  51.76 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  49.41 
 
 
464 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 
401 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  41 
 
 
423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  43.2 
 
 
434 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  41.71 
 
 
489 aa  164  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  43.72 
 
 
426 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  43.72 
 
 
426 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  45.41 
 
 
427 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  44.26 
 
 
417 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  41.09 
 
 
422 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  40.21 
 
 
428 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  40.21 
 
 
428 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  40.21 
 
 
428 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  49.68 
 
 
380 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  44.63 
 
 
415 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  44.63 
 
 
415 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  41.5 
 
 
207 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  38.69 
 
 
405 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  43.55 
 
 
417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  43.55 
 
 
417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  42 
 
 
458 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  47.65 
 
 
413 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  47.77 
 
 
402 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  44.38 
 
 
422 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  43 
 
 
450 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  43 
 
 
415 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  43 
 
 
450 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  46.96 
 
 
429 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  41 
 
 
448 aa  144  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  43.82 
 
 
414 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  46.41 
 
 
426 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  43.01 
 
 
417 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  40.56 
 
 
417 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  40.56 
 
 
417 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  40.56 
 
 
417 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  40.56 
 
 
417 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  40.56 
 
 
417 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  46.3 
 
 
406 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  46.59 
 
 
454 aa  141  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  47.59 
 
 
416 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  42.02 
 
 
408 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>