227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5277 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 460 aa  904    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  70.87 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  56.44 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  42.36 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  41.97 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  63.38 
 
 		 224 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  66.5 
 
 		 209 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  67.33 
 
 		 216 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  64.93 
 
 		 220 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  37.33 
 
 		 444 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  64.11 
 
 		 220 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  64.11 
 
 		 220 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  64.11 
 
 		 220 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  64.11 
 
 		 220 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  65.5 
 
 		 209 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  61.9 
 
 		 220 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  64.5 
 
 		 209 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  65.02 
 
 		 211 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  65.02 
 
 		 211 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  65.02 
 
 		 211 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  66.15 
 
 		 209 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  66.15 
 
 		 209 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  35.84 
 
 		 464 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  38.12 
 
 		 413 aa  240  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  35.28 
 
 		 423 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  32.31 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  57.95 
 
 		 208 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  52.88 
 
 		 220 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  53.92 
 
 		 213 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.85 
 
 		 434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  52.43 
 
 		 249 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  30.22 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  45.56 
 
 		 252 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  30.96 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  52.94 
 
 		 261 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  49.25 
 
 		 212 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  53.92 
 
 		 251 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  30.4 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  32.58 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  30.48 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  32.58 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  49.54 
 
 		 245 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  49.54 
 
 		 245 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  32.73 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.71 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  54.82 
 
 		 238 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  30.45 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  32.77 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  34.07 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  50.52 
 
 		 205 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  49.24 
 
 		 204 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  32.31 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  49.51 
 
 		 221 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  32.31 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  32.89 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  31.7 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  47.47 
 
 		 216 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  32.09 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  31.33 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  32.13 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  33.78 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  46.43 
 
 		 207 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  45.92 
 
 		 207 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  31.63 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  45.41 
 
 		 207 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  33.56 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  30.17 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  51.24 
 
 		 215 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  46.23 
 
 		 207 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  47.45 
 
 		 207 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  48.04 
 
 		 221 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  48.04 
 
 		 220 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  48.04 
 
 		 221 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  31.24 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  45.41 
 
 		 221 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  48.04 
 
 		 220 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  51.49 
 
 		 218 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  51.46 
 
 		 245 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  47.96 
 
 		 206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  47.25 
 
 		 247 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  47.21 
 
 		 214 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  48.02 
 
 		 210 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  48.31 
 
 		 215 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  47.96 
 
 		 206 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  30.93 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  47.4 
 
 		 209 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  46.41 
 
 		 218 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  31.25 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  47.74 
 
 		 206 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  30.93 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  30.93 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  30.93 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  30.93 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  30.93 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  33.71 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>