225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3536 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 449 aa  899    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  56.44 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  55.38 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  43.08 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  42.16 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  67.33 
 
 		 224 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  67.14 
 
 		 220 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  67.46 
 
 		 216 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  68.02 
 
 		 209 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  61.19 
 
 		 220 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  64.76 
 
 		 220 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  64.76 
 
 		 220 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  64.76 
 
 		 220 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  64.76 
 
 		 220 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  67.82 
 
 		 211 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  67.82 
 
 		 211 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  67.82 
 
 		 211 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  68.02 
 
 		 209 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  68.02 
 
 		 209 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  66.5 
 
 		 209 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  37.3 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  65.5 
 
 		 209 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  34.55 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  59.13 
 
 		 261 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  34.83 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  58.65 
 
 		 251 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  33.41 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  34.3 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  53.85 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  56.5 
 
 		 213 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  30.84 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  34.65 
 
 		 413 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  58.42 
 
 		 245 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  31.11 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  54.07 
 
 		 221 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  32.2 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  50.23 
 
 		 220 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  32.2 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  56.46 
 
 		 218 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  51.46 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  50.23 
 
 		 220 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  51.47 
 
 		 221 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  51.47 
 
 		 221 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  31.97 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  51.52 
 
 		 212 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  33.09 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  48.02 
 
 		 216 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  51.78 
 
 		 208 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  55.02 
 
 		 218 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  53.43 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  33.49 
 
 		 415 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  31.46 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  32.02 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  33.56 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  48.56 
 
 		 207 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  49.51 
 
 		 220 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  31.82 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  32.71 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  31.82 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  32.71 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  51.21 
 
 		 205 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  48.95 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  32.74 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  49.04 
 
 		 207 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  52.78 
 
 		 238 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  32.63 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  48.56 
 
 		 207 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  31.01 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  32.95 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  31.74 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  32.81 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  31.25 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  50 
 
 		 206 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  32.21 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  32.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 215 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  32.63 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  47.6 
 
 		 206 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.59 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  47.8 
 
 		 209 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  44.18 
 
 		 245 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  48.08 
 
 		 207 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  49.04 
 
 		 206 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  32.48 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  31.99 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  31.99 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  31.99 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>