219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1864 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 426 aa  871    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  99.53 
 
 		 426 aa  864    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  88.73 
 
 		 427 aa  767    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  53.35 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  50.12 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  53.17 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  43.65 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  41.99 
 
 		 423 aa  292  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  38.07 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  35.7 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  35.05 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  35.7 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  36.89 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  36.21 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  36.76 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  35.34 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  37.8 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  36.83 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  35.02 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  36.36 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  36.36 
 
 		 417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  36.3 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  36.3 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  35.64 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  36.34 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  35.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  35.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  35.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  35.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  35.61 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  34.95 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  35.59 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  34.06 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  31.05 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  30.1 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  30.04 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  31.82 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  28.57 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  48.17 
 
 		 219 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  28.99 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  28.6 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  28.99 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  28.57 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  44.04 
 
 		 205 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  30.17 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  44.67 
 
 		 208 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  30.16 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  29.98 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  28.74 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  28.06 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  28.06 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  28.06 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  28.91 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  45.95 
 
 		 201 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  47.12 
 
 		 204 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  27.82 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  27.82 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  27.82 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  30.07 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  42.41 
 
 		 204 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  43.65 
 
 		 207 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  42.21 
 
 		 207 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  42.19 
 
 		 206 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  29.95 
 
 		 419 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  46.82 
 
 		 212 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  45.05 
 
 		 207 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  40.8 
 
 		 209 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  43.23 
 
 		 206 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  29.64 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  41.62 
 
 		 207 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  43.68 
 
 		 205 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  43.68 
 
 		 205 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  41.71 
 
 		 207 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  43.23 
 
 		 206 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  29.37 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  29.37 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  29.37 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  29.37 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  44.79 
 
 		 220 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  29.37 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  41.35 
 
 		 215 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  42.65 
 
 		 209 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  28.61 
 
 		 416 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  46.32 
 
 		 214 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 220 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  42.63 
 
 		 205 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  44.56 
 
 		 211 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  44.56 
 
 		 211 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  44.56 
 
 		 211 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>