215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3510 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  955    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  38.22 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  33.41 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  34.97 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  36.64 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  33.5 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  33.25 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  34.07 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  34.01 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.75 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  31.59 
 
 		 489 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  31.4 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  32.77 
 
 		 416 aa  204  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  35.96 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  32.23 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  31.31 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  50.76 
 
 		 212 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  33.25 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  32.21 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.41 
 
 		 458 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  32.05 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.8 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  30.79 
 
 		 415 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  31.11 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  51.79 
 
 		 208 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  28.03 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  30.27 
 
 		 426 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  31.41 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  31.81 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  48.47 
 
 		 207 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  47.96 
 
 		 207 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  30.54 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  30.28 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  30.28 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  47.96 
 
 		 207 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  30.28 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  31.07 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  30.73 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  30.9 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  47.22 
 
 		 220 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  36.68 
 
 		 324 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  46.94 
 
 		 207 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  30.75 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  51.27 
 
 		 210 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  45.96 
 
 		 204 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  30.51 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  30.51 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  30.51 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  30.51 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  28.64 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  28.64 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  46.43 
 
 		 207 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  30.1 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  46.15 
 
 		 205 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.82 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  29.72 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  48.95 
 
 		 213 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  27.3 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  28.07 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  46.73 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  28.07 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  28.07 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  28.07 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  48.6 
 
 		 206 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  45.32 
 
 		 209 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  28.07 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  28.07 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  48.54 
 
 		 215 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  28.07 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  28.07 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  28.07 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  27.59 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  45.92 
 
 		 245 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  48.04 
 
 		 206 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  47.75 
 
 		 206 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  46.77 
 
 		 216 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 249 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  48.31 
 
 		 245 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  31.69 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  43.65 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  48.21 
 
 		 215 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  44.55 
 
 		 212 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  44.66 
 
 		 223 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  46.84 
 
 		 220 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  49.41 
 
 		 209 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  28.17 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  28.97 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  28.97 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  28.97 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  49.41 
 
 		 220 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  49.41 
 
 		 220 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  49.41 
 
 		 220 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>