210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1850 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  94.85 
 
 		 429 aa  799    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  100 
 
 		 426 aa  860    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  70.59 
 
 		 450 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  70.59 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  72.34 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  70.62 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  70.33 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  64.65 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  64.89 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  64.65 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  64.65 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  64.89 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  63.99 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  64.48 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  63.99 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  63.99 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  64.23 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  64.48 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  63.77 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  66.33 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  63.5 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  65.06 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  68.01 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  42.46 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  37.06 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  38.17 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  38.52 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  37.9 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  32.6 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  32.19 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.28 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  32.37 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  32.28 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.99 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  31.19 
 
 		 448 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.25 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  28.78 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  32.4 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  31.5 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  31.63 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  30.17 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  30.6 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  30.6 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  29.07 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  29.93 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  29.06 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  29.52 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  31.16 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  30.07 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.26 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  29.5 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  48.39 
 
 		 205 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  48.39 
 
 		 205 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  29.55 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  48.39 
 
 		 205 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  29.98 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  47.4 
 
 		 210 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  44.21 
 
 		 213 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  29.84 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  29.22 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.79 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  31.15 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  44.74 
 
 		 210 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  33.57 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  45.55 
 
 		 209 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  45.41 
 
 		 216 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  46.24 
 
 		 205 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  46.24 
 
 		 205 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  46.24 
 
 		 205 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  46.24 
 
 		 205 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 213 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  46.49 
 
 		 213 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  40.21 
 
 		 212 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  41.49 
 
 		 207 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  41.79 
 
 		 209 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  43.52 
 
 		 220 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.79 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2233  paraquat-inducible protein A  42.18 
 
 		 237 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.80452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  44.83 
 
 		 213 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  41.45 
 
 		 206 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  41.75 
 
 		 207 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  40.41 
 
 		 206 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  41.45 
 
 		 206 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  28.07 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  42.27 
 
 		 207 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  42.05 
 
 		 224 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>