215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3076 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 405 aa  826    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  59.54 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  50.65 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  45.59 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  40.45 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  37.41 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  38.9 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  38.31 
 
 		 426 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  37.29 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  36.49 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  36.49 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  36.49 
 
 		 428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  37.92 
 
 		 448 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  38.1 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  36.76 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  37.26 
 
 		 414 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  37.25 
 
 		 415 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  37.99 
 
 		 422 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  39.85 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  34.54 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  37.77 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  37.53 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  37.14 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  37.14 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  37.14 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  37.14 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  37.14 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  35.44 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  34.95 
 
 		 426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  35.04 
 
 		 426 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  34.05 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.86 
 
 		 449 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  31.74 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  29.84 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  32.23 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  31.59 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  31.39 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  31.39 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  31.39 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.59 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  43.27 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  29.21 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  47.85 
 
 		 205 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  28.54 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  46.01 
 
 		 206 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  45.93 
 
 		 207 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  40.82 
 
 		 207 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  47.46 
 
 		 212 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  27.79 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  39.42 
 
 		 207 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  28.54 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  41.88 
 
 		 207 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  42.78 
 
 		 220 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  41.45 
 
 		 215 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  45.4 
 
 		 206 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  39.71 
 
 		 216 aa  156  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  43.86 
 
 		 206 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  43.64 
 
 		 207 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  25.49 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  26 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  46.58 
 
 		 224 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  27.36 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  26.18 
 
 		 427 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  25.94 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  25.94 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  25.94 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  25.94 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  25.94 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  39.58 
 
 		 252 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  25.94 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  40.88 
 
 		 249 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  26.01 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  25.69 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  44.38 
 
 		 213 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  43.35 
 
 		 214 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  45.2 
 
 		 204 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  29.13 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  26.02 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  47.44 
 
 		 209 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  43.29 
 
 		 209 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  40.68 
 
 		 201 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  26.08 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  47.51 
 
 		 210 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  26.08 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  45.3 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  26.08 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  36.67 
 
 		 245 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  26.08 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  26.08 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  48.28 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  43.82 
 
 		 223 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  41.08 
 
 		 220 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  40.11 
 
 		 245 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>