211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0713 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  99.55 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  93.21 
 
 		 220 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  92.31 
 
 		 220 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  83.71 
 
 		 221 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  87.33 
 
 		 221 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  74.41 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  73.61 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  63.98 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  63.03 
 
 		 261 aa  277  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  64.5 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  51.46 
 
 		 449 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  43.6 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  48.04 
 
 		 460 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  47.12 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  44.21 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  43.15 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  42.72 
 
 		 462 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  36.89 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  45.88 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  47.37 
 
 		 204 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  40.45 
 
 		 423 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  38.66 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  46.78 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  40.37 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  39.36 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  39.36 
 
 		 259 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  38.07 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  34.74 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  37.31 
 
 		 449 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  35.64 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  35.15 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  36.76 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  34.31 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  34.2 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  31.96 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.12 
 
 		 402 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  35.92 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  30.65 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25.24 
 
 		 405 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  28.12 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  30.61 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  27.14 
 
 		 406 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  27.86 
 
 		 434 aa  95.5  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  30.1 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  30.96 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  30.39 
 
 		 427 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  30.67 
 
 		 489 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  32.11 
 
 		 413 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.92 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  30.32 
 
 		 450 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  30.32 
 
 		 415 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  27.92 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.75 
 
 		 464 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  27.46 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  27.98 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  29.44 
 
 		 423 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.38 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.98 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  27.18 
 
 		 419 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  28.35 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  32.4 
 
 		 429 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  29.27 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  32.4 
 
 		 426 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  31.15 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  28.35 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  28.87 
 
 		 412 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  28.35 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  30.54 
 
 		 450 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 427 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  27.46 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  28.35 
 
 		 427 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  28.35 
 
 		 427 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  28.37 
 
 		 444 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  27.8 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  23.41 
 
 		 401 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  24.75 
 
 		 426 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  28.64 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  27.46 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>