209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1931 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  70.67 
 
 		 208 aa  317  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  68.6 
 
 		 210 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  70 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  64.42 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  69.52 
 
 		 211 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  69.9 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  64.9 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  69.71 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  63.24 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  66.88 
 
 		 161 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  29.13 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  32.34 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  30.14 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  27.09 
 
 		 416 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  28.27 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  27.92 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30.85 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  24.75 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.36 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  28.36 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  26.37 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  24.39 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  31.98 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  23.65 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  23.65 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  23.65 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  23.65 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  23.65 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  25.37 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  28.83 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  21.74 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  21.74 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  31.09 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  21.74 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  24.88 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  28.14 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  20.77 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  23.08 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  25.49 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  24.88 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  23.04 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  24.88 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  25.87 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  23.92 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  22.5 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  24.89 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  23.92 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  23.92 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  25.93 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  26.09 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  21.18 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  23.92 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  28 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  23.92 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  28.92 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  25.87 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  24.32 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  23.44 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  23.44 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  26.5 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  24.75 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  26.73 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  23.44 
 
 		 448 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  29 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  27.72 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.87 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>