211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4782 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  79 
 
 		 219 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  79.45 
 
 		 219 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  78.54 
 
 		 219 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  76.26 
 
 		 219 aa  316  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  65.9 
 
 		 218 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  65.9 
 
 		 235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  67.89 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  33.83 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  33.83 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  37.85 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  32.34 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  34.53 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  35.18 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  34.48 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  34.54 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  34.38 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  32.34 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  35.41 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  32.29 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  33.66 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  37.42 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  31.82 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  35.15 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  32.34 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  36.18 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  33.85 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  33.66 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  31.77 
 
 		 423 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  34.33 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  30.24 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  31.34 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  32.35 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  35.29 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  35.96 
 
 		 449 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  33.83 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  34.36 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  27.88 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  33.01 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  28.33 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  30.05 
 
 		 402 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.41 
 
 		 449 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  32.18 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  32.18 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  34.69 
 
 		 460 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.9 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  32.5 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  34.5 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  28.21 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  31.67 
 
 		 464 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 444 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  27.6 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  30.62 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  27.23 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  32.24 
 
 		 292 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  32.51 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.87 
 
 		 458 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  32.51 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  32.02 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  32.02 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  33.97 
 
 		 462 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  32.02 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  28.7 
 
 		 489 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  29.19 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  29.19 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  30.3 
 
 		 416 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  26.26 
 
 		 419 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  29.31 
 
 		 417 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  29.31 
 
 		 417 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>