209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0259 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  73.33 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  37.63 
 
 		 221 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  38.86 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  38.86 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  38.66 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  37.31 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  37.11 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  35.57 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  37.11 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  35.05 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  36.08 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  33.51 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  38.78 
 
 		 423 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  39.49 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  36.97 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  35.71 
 
 		 449 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  37.31 
 
 		 449 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  33.67 
 
 		 460 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  35.38 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  33.68 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  37.5 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  30.26 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  28.14 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30.81 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.68 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  31.44 
 
 		 406 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  32.52 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  37.24 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  33.5 
 
 		 462 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  31.47 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  28.65 
 
 		 208 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  29.95 
 
 		 405 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  31.02 
 
 		 402 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  29.95 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  30.88 
 
 		 444 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  30.93 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  26.15 
 
 		 419 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  26.53 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  26.67 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  26.8 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  24.49 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  27.92 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  29.21 
 
 		 434 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  24.47 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  24.49 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  29.08 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  29.02 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  29.02 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  29.02 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  29.02 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.96 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  28.5 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  27.27 
 
 		 428 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  28.5 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  28.5 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  28.5 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  31.63 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  25.53 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  29.38 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 415 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 450 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  27.84 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  28.5 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  26.77 
 
 		 428 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  28.8 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.67 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  31.93 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  28.12 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  24.21 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  26.6 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  26.6 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  28.79 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  27.04 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>