218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0808 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  62.36 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  49.15 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  55.48 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  43.56 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  44.83 
 
 		 449 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  44.79 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  42.94 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  42.33 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  41.72 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  43.67 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  43.67 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  43.04 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  41.76 
 
 		 449 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  44.1 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  39.88 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  44.94 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  39.88 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  49.71 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  46.63 
 
 		 204 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  41.86 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  42.2 
 
 		 423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  34.95 
 
 		 460 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  35.4 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  37.28 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  36.97 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  36.69 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  32.24 
 
 		 212 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  35.5 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  37.21 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  34.78 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  35.15 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  40.99 
 
 		 462 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  36.53 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  34.48 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  34.48 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  36.26 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  34.78 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  35.52 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  31.95 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  31.73 
 
 		 464 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 		 198 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  32.73 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  36.2 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  34.36 
 
 		 413 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  33.12 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  29.95 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  33.54 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  32.3 
 
 		 406 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  36.02 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  31.87 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.24 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  29.28 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  30.99 
 
 		 444 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  31.71 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  30.12 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  30.18 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  30.95 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  28.92 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  30.67 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  29.48 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  31.36 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  34.97 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  34.97 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  30.43 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  24.24 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  30.23 
 
 		 419 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  32.52 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  33.14 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  27.36 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  31.36 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  31.06 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  28.83 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  26.51 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  33.33 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  29.09 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  27.91 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  33.96 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  33.96 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  29.65 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  32.53 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  34.75 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  34.67 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  34.67 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  30.82 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  28.77 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  30.59 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>