209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0532 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  94.59 
 
 		 259 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  79.59 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  39.9 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  42.55 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  43.62 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  39.23 
 
 		 213 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  39.27 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  39.17 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  38.71 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  39.36 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  39.36 
 
 		 221 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  38.34 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  39.36 
 
 		 221 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  43.09 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  36.79 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  37.82 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  34.03 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  35.94 
 
 		 204 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  32.98 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  39.18 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  32.98 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  34.44 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  34.48 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  32.09 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  32.14 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  32.81 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  34.21 
 
 		 449 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  36.14 
 
 		 462 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  30.73 
 
 		 199 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 		 449 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  33.86 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  34.39 
 
 		 219 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  31.28 
 
 		 460 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  34.39 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  34.43 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  28.79 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  32.95 
 
 		 423 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 198 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 		 219 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  30.88 
 
 		 413 aa  85.1  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  29.8 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  29.8 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  31.18 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  28.35 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  26.63 
 
 		 434 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  27.89 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  30.64 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.84 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.12 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  27.08 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  25.97 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  24.63 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.29 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  24.76 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.23 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  25.39 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  23.56 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29.02 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  25.36 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  24.3 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.29 
 
 		 489 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  24.57 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1569  paraquat-inducible protein A  29.05 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.70952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  25.84 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  28.12 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  24.23 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  24.15 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  25.93 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  23.68 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  23.39 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  24.41 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  27.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  23.56 
 
 		 422 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  27.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  26.03 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  23.11 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  24.57 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  27.01 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>