171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1569 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1569  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.70952  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  45.69 
 
 
205 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 
226 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  30.98 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  27.55 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  31.61 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.59 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  28.71 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  25.13 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  34.05 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  25.64 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.9 
 
 
406 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  27.43 
 
 
449 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  28.43 
 
 
427 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  30.22 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  31.52 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  26.63 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  26.63 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  26.63 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  26.24 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.45 
 
 
464 aa  72.4  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  29.7 
 
 
458 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  29.81 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  28.48 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  26.78 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  28.57 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  25.41 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  25.41 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  29.05 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  29.05 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  29.09 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  27.41 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  26.22 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  25.28 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  25.63 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  29.84 
 
 
422 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  26.01 
 
 
444 aa  65.1  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25.89 
 
 
426 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.89 
 
 
426 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  25.63 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.76 
 
 
423 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  27.51 
 
 
448 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.53 
 
 
405 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  26.56 
 
 
422 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  24.04 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  26.17 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  25.48 
 
 
428 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 
428 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  24.39 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  23.47 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  26.67 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  24.52 
 
 
428 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 
417 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 
417 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  26.6 
 
 
417 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  27.6 
 
 
423 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  29.57 
 
 
417 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  23.96 
 
 
414 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  26.47 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  28.04 
 
 
427 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  28.04 
 
 
427 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  25.51 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  28.04 
 
 
427 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  28.04 
 
 
427 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  28.04 
 
 
427 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  29.35 
 
 
417 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  26.49 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  28.33 
 
 
417 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  28.33 
 
 
417 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  25.95 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  28.33 
 
 
417 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  25.26 
 
 
415 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  28.33 
 
 
417 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  26.46 
 
 
429 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  25.26 
 
 
415 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  25.12 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  25.25 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  25.25 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  25.25 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>