210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2895 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  50.49 
 
 		 229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  51.47 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  45.54 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  44.62 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  44.6 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  43.78 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  44.29 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  44.12 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  41.63 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  44.5 
 
 		 460 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  40.19 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  41.58 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  39.23 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  42.86 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  41.06 
 
 		 462 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  36.54 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  41.86 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  43.98 
 
 		 449 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  35.6 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  40.76 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  41.8 
 
 		 423 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  35.53 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  45.88 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  35.23 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  34.18 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  45.18 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  40.24 
 
 		 449 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  38.97 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  38.97 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  41.27 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  30.96 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  34.97 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  36.93 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  38.54 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  37.02 
 
 		 413 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  35.29 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  34.85 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  37.5 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  36.46 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  31.84 
 
 		 406 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  28.23 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  31.16 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  31.82 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  28.95 
 
 		 464 aa  88.6  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  27.83 
 
 		 434 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  31.98 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  26.46 
 
 		 402 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  27.59 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.47 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  28.57 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  24.02 
 
 		 426 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  30.26 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  29.8 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  23.67 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  28.21 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  28.21 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  28.08 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  28 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  28.95 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  27.88 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  30.49 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  28.92 
 
 		 450 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  30.05 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25.27 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  28.92 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  32.14 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.3 
 
 		 422 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  32.78 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29.22 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  26.53 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  31.98 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  29.08 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  31.98 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  31.98 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>