210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0330 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  73.33 
 
 		 198 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  38.27 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  38.07 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  38.27 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  37.56 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  37.56 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  36.55 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  35.85 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  34.18 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  35.82 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  37.56 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  35.57 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  35.4 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  30.09 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  34.17 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  28.18 
 
 		 419 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  34.01 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  35.32 
 
 		 460 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  38.14 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  31.73 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  31.58 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  36.76 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  34.85 
 
 		 449 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 423 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  30.41 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  31.55 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  29.44 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  29.81 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  30.62 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  32.49 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  34.85 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  31.07 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  38.02 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  30.32 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  30.21 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  38.61 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  30.15 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  27.69 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  29.47 
 
 		 405 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  30.81 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.65 
 
 		 464 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  30.99 
 
 		 462 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  30.69 
 
 		 402 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  28.87 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  27.37 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  28.12 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  25.6 
 
 		 416 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  30.05 
 
 		 406 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  29.69 
 
 		 444 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  30.14 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.23 
 
 		 423 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  26.84 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  25.79 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  26.55 
 
 		 417 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  26.55 
 
 		 417 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  25.74 
 
 		 324 aa  88.6  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.69 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  31.79 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  25.99 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  23.81 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  22.49 
 
 		 408 aa  85.1  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  29.19 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  23.86 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  22.73 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  26.4 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  32.82 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  24.31 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  26.11 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  26.11 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.38 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>