206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2694 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  44.62 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1569  paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.70952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  35.23 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  31.1 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  31.07 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  34.45 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  34.18 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  29.13 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  35.32 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  30.41 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  32.21 
 
 		 423 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  31.88 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  33.18 
 
 		 449 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  40.1 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  32.04 
 
 		 444 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  31.46 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  29.19 
 
 		 426 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  32.02 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.78 
 
 		 402 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  31.58 
 
 		 406 aa  89.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  27.93 
 
 		 426 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  27.93 
 
 		 426 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  31.19 
 
 		 413 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  27.78 
 
 		 427 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  31.9 
 
 		 423 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  33.13 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  34.65 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  34.36 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  25.98 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  29.28 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  27.8 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  28.99 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  31.18 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  32.76 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  31.61 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  26.9 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  31.88 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  29.38 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  26.9 
 
 		 415 aa  78.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  30.06 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  31.33 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.31 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  29.48 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  29.5 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  30.09 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  29.33 
 
 		 460 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  27.23 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  25.89 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  28.16 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.32 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  31.63 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  25.51 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  28.16 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  25.13 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  25.64 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  26.96 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  31.29 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  26.11 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  24.62 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  23.72 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  23.81 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  26.15 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  23.72 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  23.72 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  27.23 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  24.38 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  27.23 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  24.65 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  24.65 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  27.23 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  27.23 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  27.23 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  23.72 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  25.38 
 
 		 448 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>