192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2441 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  85.79 
 
 		 199 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  65.82 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  66.33 
 
 		 198 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  56.19 
 
 		 212 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  46.94 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  45.45 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  34.21 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  32.47 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  31.61 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  31.09 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  29.74 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  29.74 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  29.74 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 259 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  29.74 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  29.74 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 		 229 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  30.94 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  33.51 
 
 		 449 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  30.61 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  30.05 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  29.02 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  32.37 
 
 		 406 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  28.87 
 
 		 460 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  32.75 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  35.52 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  32.94 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  34.43 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  34.71 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  35.52 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  32.35 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.88 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  32.49 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  30.9 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  30.24 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  29.83 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  31.63 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  33.88 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  30.21 
 
 		 464 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  25.93 
 
 		 434 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  29.47 
 
 		 449 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  27.32 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  32.56 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  26.73 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  30.72 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  27.64 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  27.18 
 
 		 415 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  27.18 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1569  paraquat-inducible protein A  30.22 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.70952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  27.84 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  26.55 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  27.84 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.84 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  25.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  25.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  25.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  25.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  25.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  24.87 
 
 		 416 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  29.02 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  25 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  25 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  26.94 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  25.98 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  25.74 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.11 
 
 		 423 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  27.13 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  26.94 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  23.86 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  24.47 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  27.75 
 
 		 450 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  29.19 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  25.25 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>