More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3687 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  82.77 
 
 
244 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  61.97 
 
 
240 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.89 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.91 
 
 
244 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.91 
 
 
244 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.46 
 
 
236 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 
253 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 
253 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.4 
 
 
247 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  54.91 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  54.91 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.91 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.53 
 
 
234 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.67 
 
 
240 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.98 
 
 
234 aa  205  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.2 
 
 
239 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.2 
 
 
239 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  44.2 
 
 
263 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.61 
 
 
237 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.23 
 
 
236 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.16 
 
 
238 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  46.61 
 
 
232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.05 
 
 
243 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.87 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.09 
 
 
236 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.73 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  46.7 
 
 
228 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.09 
 
 
236 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 
262 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 
262 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.95 
 
 
234 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.98 
 
 
265 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.98 
 
 
240 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45 
 
 
235 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.21 
 
 
226 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.09 
 
 
235 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  44 
 
 
238 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.75 
 
 
226 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.09 
 
 
235 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.75 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
238 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.2 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  46.61 
 
 
237 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.09 
 
 
242 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.1 
 
 
254 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  44.54 
 
 
254 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
238 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.93 
 
 
238 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  44.78 
 
 
242 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  42.01 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  43.11 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.7 
 
 
242 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.78 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  44.09 
 
 
232 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 
251 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.11 
 
 
231 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.95 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.41 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  44.02 
 
 
232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.32 
 
 
238 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.44 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.53 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  44.5 
 
 
232 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.5 
 
 
232 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.66 
 
 
234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  35.24 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  33.75 
 
 
240 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.65 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  33.62 
 
 
644 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.2 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  37.17 
 
 
220 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.24 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  35.65 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  37.5 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  32.6 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  33.48 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  37.78 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  37.95 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.14 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.59 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
233 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  36.36 
 
 
287 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
233 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
233 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
233 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
233 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>