More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5945 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  92.13 
 
 
254 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  85.06 
 
 
251 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.37 
 
 
265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  70.98 
 
 
265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  70.2 
 
 
265 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.22 
 
 
262 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.22 
 
 
262 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.48 
 
 
240 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.21 
 
 
241 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  61.84 
 
 
242 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.4 
 
 
230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.44 
 
 
238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.73 
 
 
239 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  59.03 
 
 
234 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  60.99 
 
 
238 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.42 
 
 
232 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.54 
 
 
238 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 
263 aa  255  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.02 
 
 
239 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.02 
 
 
239 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
238 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.64 
 
 
237 aa  252  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.29 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  57.01 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
234 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  58.85 
 
 
232 aa  248  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.71 
 
 
235 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.27 
 
 
240 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.64 
 
 
234 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.67 
 
 
236 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.11 
 
 
226 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.91 
 
 
235 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.22 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.3 
 
 
236 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.36 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 
226 aa  244  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.07 
 
 
232 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 
226 aa  244  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  57.66 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  57.66 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 
226 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.59 
 
 
241 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.36 
 
 
243 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.89 
 
 
227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.89 
 
 
242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.27 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  56.22 
 
 
237 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.34 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.25 
 
 
238 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 
238 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.36 
 
 
234 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  53.78 
 
 
232 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.07 
 
 
231 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.78 
 
 
232 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.37 
 
 
253 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.37 
 
 
253 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  47.81 
 
 
240 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.05 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  44.1 
 
 
244 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.74 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  48.82 
 
 
247 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  48.82 
 
 
247 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.3 
 
 
236 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.13 
 
 
244 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.13 
 
 
244 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  42.29 
 
 
230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  40.44 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  38.89 
 
 
232 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.81 
 
 
238 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  39.8 
 
 
236 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  39.8 
 
 
236 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  39.8 
 
 
236 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  39.8 
 
 
236 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  41.29 
 
 
243 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  36.78 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.79 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  39.3 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.79 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.17 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  35.35 
 
 
242 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  40.59 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  39.8 
 
 
234 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 
228 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
244 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  39.8 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  39.3 
 
 
236 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>