More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4777 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  77.09 
 
 		 234 aa  356  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.68 
 
 		 238 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  63.23 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.88 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.82 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.91 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.27 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.27 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.27 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  58.67 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.95 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.17 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  58.67 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.09 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  58.3 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  57.21 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.89 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.17 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.42 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.41 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.62 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  62.67 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.46 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.41 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.11 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.89 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.82 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.22 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.8 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.37 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  58.67 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.4 
 
 		 251 aa  237  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.36 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  56.25 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.21 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.11 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.45 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.28 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.14 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.84 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.5 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.33 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  51.33 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.84 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  46.19 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.58 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.58 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  48.33 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  48.33 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  43.5 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.98 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.98 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.02 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  44.02 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.18 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.18 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  40 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 654 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  32.2 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  35.16 
 
 		 653 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  32.13 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  33.33 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  36.7 
 
 		 652 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  35.68 
 
 		 388 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  31.71 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  35.78 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  33.66 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  36.15 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  39.56 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 643 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  39.9 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  39.47 
 
 		 276 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>