More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1586 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  81.5 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.64 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.64 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.09 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.22 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  46.64 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.29 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.3 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.15 
 
 		 242 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.5 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  43.67 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.29 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.36 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.36 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.29 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.48 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  47.12 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  46.19 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.86 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.98 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  46.19 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.48 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.45 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.45 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  42.54 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.92 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  43.23 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.33 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.84 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.11 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  40.79 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.13 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.61 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.47 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  44.04 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.53 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  44.04 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.91 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.91 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.45 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.21 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  45.07 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.45 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  43.66 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.85 
 
 		 251 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.6 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.29 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  41.36 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.09 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.65 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.65 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.65 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.65 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.65 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.38 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  41.85 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  43.24 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.24 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.94 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.98 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.92 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.02 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.25 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  34.35 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  36.62 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  34.76 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  35.37 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  34.65 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  37.21 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.53 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  32.14 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  32.89 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  32.02 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  33.18 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.84 
 
 		 568 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.5 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  36.92 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>