More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3352 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  99.17 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  98.75 
 
 
265 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  99.17 
 
 
265 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  99.17 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  99.58 
 
 
265 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.48 
 
 
254 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  72.61 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  72.17 
 
 
251 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  62.72 
 
 
242 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.67 
 
 
241 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.8 
 
 
239 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.58 
 
 
230 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.44 
 
 
226 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.63 
 
 
237 aa  247  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 
238 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 
226 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  56 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 
226 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  56 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.14 
 
 
235 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56 
 
 
226 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 
238 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.47 
 
 
234 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
238 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.59 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.52 
 
 
234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.6 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.16 
 
 
239 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  54.3 
 
 
238 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.09 
 
 
240 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.16 
 
 
239 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 
263 aa  239  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
235 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.88 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.91 
 
 
235 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.33 
 
 
243 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.75 
 
 
236 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.36 
 
 
236 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.31 
 
 
232 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.52 
 
 
236 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.4 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.53 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.61 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.56 
 
 
242 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.4 
 
 
235 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.82 
 
 
227 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  55.4 
 
 
237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.73 
 
 
238 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.99 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.67 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  54.67 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.86 
 
 
231 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.56 
 
 
238 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.85 
 
 
253 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.85 
 
 
253 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  44.3 
 
 
244 aa  189  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.6 
 
 
247 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  46.05 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  49.77 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  49.77 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.81 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.81 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 
245 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.79 
 
 
236 aa  178  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.23 
 
 
236 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  39.65 
 
 
230 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  41.36 
 
 
228 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  36.84 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 
228 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  39.5 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  34.93 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  33.78 
 
 
243 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  40.5 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  39.5 
 
 
243 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  39 
 
 
236 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  39 
 
 
236 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  39 
 
 
236 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  39 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  34.48 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  36.76 
 
 
226 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  38.81 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  31.8 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  39.5 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.9 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  36.41 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  33.02 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  31.9 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  40.54 
 
 
287 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  38.5 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  35.47 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  36.68 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  34.9 
 
 
223 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>