More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0429 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.96 
 
 
253 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.96 
 
 
253 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  57.33 
 
 
240 aa  261  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.46 
 
 
244 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.46 
 
 
244 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.85 
 
 
236 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.25 
 
 
247 aa  243  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.85 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  54.91 
 
 
245 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  52.23 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.39 
 
 
234 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.53 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.53 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.62 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.71 
 
 
240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.06 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.85 
 
 
239 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.32 
 
 
241 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.82 
 
 
235 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.41 
 
 
226 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.68 
 
 
241 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.7 
 
 
238 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  43.3 
 
 
232 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  44.95 
 
 
226 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
226 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  44.95 
 
 
226 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  48.25 
 
 
242 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.95 
 
 
236 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
226 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.95 
 
 
230 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
226 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.25 
 
 
235 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.16 
 
 
243 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.95 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.13 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.41 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  47.87 
 
 
236 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.45 
 
 
232 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  47.39 
 
 
236 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.11 
 
 
237 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.61 
 
 
242 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.3 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.3 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.3 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.77 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.77 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.3 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  45.58 
 
 
228 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.65 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.78 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  43.58 
 
 
232 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  42.67 
 
 
238 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.58 
 
 
238 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
238 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.7 
 
 
238 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.22 
 
 
231 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
238 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.89 
 
 
238 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  51.18 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  44.04 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  45.97 
 
 
232 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.24 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  47.44 
 
 
237 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.82 
 
 
254 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.72 
 
 
238 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.33 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.75 
 
 
234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.79 
 
 
227 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.63 
 
 
232 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  41.63 
 
 
232 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.74 
 
 
229 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
240 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.93 
 
 
232 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  37.85 
 
 
229 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  39.23 
 
 
227 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.1 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.76 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.95 
 
 
568 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  38.21 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.29 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  37.67 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.1 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.41 
 
 
232 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1626  ABC transporter related  37.57 
 
 
229 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.41 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.68 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.31 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  39.21 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 
237 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.58 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  38.21 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.57 
 
 
233 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.68 
 
 
233 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>