More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2918 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  70.89 
 
 
238 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  69.79 
 
 
241 aa  332  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.33 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  52.54 
 
 
236 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.08 
 
 
239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  52.54 
 
 
236 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  52.99 
 
 
232 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
240 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 
234 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.65 
 
 
230 aa  234  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.5 
 
 
237 aa  234  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.85 
 
 
234 aa  232  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  53.95 
 
 
242 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.84 
 
 
235 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  50.43 
 
 
232 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.93 
 
 
241 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.14 
 
 
235 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  51.74 
 
 
234 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.02 
 
 
226 aa  228  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  53.57 
 
 
226 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.57 
 
 
226 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.57 
 
 
226 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  53.57 
 
 
226 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.57 
 
 
226 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.72 
 
 
239 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.57 
 
 
226 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.25 
 
 
242 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.57 
 
 
226 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  51.72 
 
 
232 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.4 
 
 
235 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.68 
 
 
226 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.29 
 
 
239 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.15 
 
 
234 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 
263 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.63 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  53.81 
 
 
238 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
238 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.7 
 
 
251 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.43 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.22 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.13 
 
 
234 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.71 
 
 
254 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.67 
 
 
238 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.71 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
238 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  52.21 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.34 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.17 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.74 
 
 
265 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.74 
 
 
265 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.74 
 
 
262 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.74 
 
 
262 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  52.4 
 
 
254 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.74 
 
 
265 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.07 
 
 
227 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.71 
 
 
231 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.31 
 
 
253 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.31 
 
 
253 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  49.33 
 
 
232 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.33 
 
 
232 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  44.89 
 
 
247 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  44.89 
 
 
247 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  43.1 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.74 
 
 
236 aa  178  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.1 
 
 
236 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.74 
 
 
247 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.04 
 
 
228 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  40.61 
 
 
244 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  40.47 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.43 
 
 
244 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.43 
 
 
244 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  38.6 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.49 
 
 
644 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.46 
 
 
225 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.28 
 
 
253 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.84 
 
 
253 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.84 
 
 
253 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  36.56 
 
 
643 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.33 
 
 
231 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  35.4 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  38.3 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.35 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.42 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.06 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  37.5 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.02 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  37.33 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  32.91 
 
 
652 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  33.19 
 
 
648 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  33.19 
 
 
648 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
408 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  38.6 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  34.2 
 
 
682 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  34.13 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.51 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  33.17 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  31.9 
 
 
653 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>