More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1311 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
242 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  68.28 
 
 
234 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  67.11 
 
 
239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  65.78 
 
 
235 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  65.33 
 
 
235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  66.22 
 
 
235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  64.16 
 
 
236 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  62.11 
 
 
232 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  63.88 
 
 
236 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  70.18 
 
 
235 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  69.78 
 
 
234 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  64 
 
 
242 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  61.21 
 
 
236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  65.5 
 
 
237 aa  286  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.21 
 
 
241 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 
238 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  57.94 
 
 
242 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.11 
 
 
238 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  56.44 
 
 
238 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.78 
 
 
238 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.13 
 
 
241 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
238 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.64 
 
 
238 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.11 
 
 
234 aa  254  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.8 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.25 
 
 
230 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.4 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.79 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.51 
 
 
238 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 
263 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.7 
 
 
239 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.7 
 
 
239 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.52 
 
 
232 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.25 
 
 
226 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.88 
 
 
226 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  53.42 
 
 
226 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 
226 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  53.42 
 
 
226 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 
226 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 
226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 
226 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.66 
 
 
234 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.04 
 
 
234 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.95 
 
 
237 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.52 
 
 
232 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  57.52 
 
 
232 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.56 
 
 
265 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.41 
 
 
227 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.56 
 
 
240 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55 
 
 
251 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
262 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
262 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  57.78 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.8 
 
 
231 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.99 
 
 
254 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.25 
 
 
238 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.81 
 
 
247 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.36 
 
 
253 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.36 
 
 
253 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  51.57 
 
 
240 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.39 
 
 
244 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.39 
 
 
244 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  49.78 
 
 
247 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  49.78 
 
 
247 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.15 
 
 
236 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.15 
 
 
236 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  46.19 
 
 
244 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  46.61 
 
 
230 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
245 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.98 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  39.13 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  33.63 
 
 
225 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  31.88 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  34.34 
 
 
242 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  30 
 
 
226 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.28 
 
 
229 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.74 
 
 
232 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.74 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  35.81 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4467  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  36.32 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  40.7 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10430  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.11 
 
 
219 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.190304  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.74 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.74 
 
 
232 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  30.77 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  29.09 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>