More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3778 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  85.06 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  83.4 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.43 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.01 
 
 		 265 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.01 
 
 		 265 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.01 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  71.01 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  72.17 
 
 		 240 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.64 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  63.16 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.7 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.56 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.18 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.33 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.9 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.69 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  60.27 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.22 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  56.56 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.65 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.02 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.65 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  58.41 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.19 
 
 		 237 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.15 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.82 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.82 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.42 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.65 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.82 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.65 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.47 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.11 
 
 		 236 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.07 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.47 
 
 		 226 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.22 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.76 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.9 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.4 
 
 		 227 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.86 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.42 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.64 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.08 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  52.28 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  53.78 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.78 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.36 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.49 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.49 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.59 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  46.93 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.19 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  50.24 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  50.24 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.74 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.98 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  38.98 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  42.54 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  41.85 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  41.71 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  40.47 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  41.5 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  39.17 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  41.5 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  40.5 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  40.5 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  40.5 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  40.5 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  35.82 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  33.49 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  34.83 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>