More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2881 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  83.19 
 
 		 238 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  82.77 
 
 		 238 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  77.88 
 
 		 238 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  78.76 
 
 		 238 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.74 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  58.62 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.62 
 
 		 239 aa  281  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.62 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.78 
 
 		 226 aa  279  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.18 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.18 
 
 		 226 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.18 
 
 		 226 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.89 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 		 226 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  59.73 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  59.73 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.29 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.19 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.39 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.08 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.19 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  59.21 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  59.47 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.11 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.93 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.67 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.78 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.7 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.18 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.09 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.22 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.82 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  58.26 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.85 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  58.8 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  59.56 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.3 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.44 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.61 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.66 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.56 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.11 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  61.36 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.58 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  55.56 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.98 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.53 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  46.64 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  43.42 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.87 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.87 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.5 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.73 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.87 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  39.45 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.43 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.79 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  43.58 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  43.58 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  40.09 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  43.11 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  36.65 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  36.65 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  36.65 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  37.23 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  35.65 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  36.1 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.74 
 
 		 647 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  35.38 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  37.68 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  38.05 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 		 646 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  38.18 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  37.25 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  37.25 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  35.22 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  34.06 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  37.38 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>