More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2291 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.88 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.88 
 
 		 236 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.73 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  61.7 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 		 245 aa  278  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  57.33 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  57.33 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.85 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.85 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  50.64 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.22 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  50.88 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  48.9 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.45 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.56 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  46.22 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.93 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.44 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.53 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.77 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.53 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.93 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.56 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.05 
 
 		 226 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.23 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.81 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.78 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.57 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.5 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.42 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.5 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.81 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.34 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.89 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  48.88 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  43.44 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.26 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  40.89 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  45.33 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.74 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  47.12 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.05 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.05 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.81 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  45.21 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.3 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.3 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.3 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.86 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  47.37 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.93 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  42.67 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.98 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.53 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.02 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.1 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.19 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  43.98 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  44.44 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.44 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.98 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.3 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  40.8 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1626  ABC transporter related  36.32 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  32.59 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  35.05 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  35.56 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  38.05 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  31.06 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  32.6 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  37.84 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>