More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2962 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  75.73 
 
 
238 aa  355  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  69.79 
 
 
238 aa  318  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.8 
 
 
234 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.27 
 
 
239 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.64 
 
 
241 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  59.73 
 
 
242 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.62 
 
 
242 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.66 
 
 
235 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.05 
 
 
226 aa  244  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.05 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.51 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.3 
 
 
234 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.81 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.78 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.74 
 
 
232 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.66 
 
 
235 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.19 
 
 
239 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.98 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.19 
 
 
235 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.91 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.31 
 
 
237 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  54.63 
 
 
238 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.58 
 
 
238 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.95 
 
 
230 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.74 
 
 
239 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.16 
 
 
226 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.04 
 
 
232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 
263 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.99 
 
 
242 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 
238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.6 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.25 
 
 
254 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  54.26 
 
 
232 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.82 
 
 
238 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.6 
 
 
251 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.16 
 
 
240 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.39 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.6 
 
 
234 aa  225  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  53.91 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.17 
 
 
253 aa  221  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.17 
 
 
253 aa  221  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  56.05 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
262 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
262 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.86 
 
 
265 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.41 
 
 
265 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.35 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.45 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.39 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.04 
 
 
227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  47.01 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  47.01 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  46.32 
 
 
247 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  46.32 
 
 
247 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  45.26 
 
 
228 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.54 
 
 
236 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.6 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  45.26 
 
 
240 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 
245 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.79 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  44.13 
 
 
230 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  37.04 
 
 
244 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  37.04 
 
 
244 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  40.79 
 
 
244 aa  161  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  37.55 
 
 
232 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.52 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.44 
 
 
233 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  39.42 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  33.48 
 
 
651 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.04 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  32.17 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  35.32 
 
 
643 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  32.69 
 
 
234 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.73 
 
 
253 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.73 
 
 
253 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  33.91 
 
 
687 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  30.9 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  32.33 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  31.65 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.06 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  34.19 
 
 
646 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  31.76 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  31.33 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.84 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  37.75 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  31.33 
 
 
652 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.48 
 
 
239 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>