More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4191 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  86.55 
 
 
241 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.16 
 
 
265 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.72 
 
 
265 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.72 
 
 
265 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.72 
 
 
262 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.72 
 
 
262 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.72 
 
 
240 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 
226 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  59.29 
 
 
226 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.29 
 
 
226 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  59.29 
 
 
226 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.29 
 
 
226 aa  262  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.78 
 
 
235 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.29 
 
 
226 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.16 
 
 
251 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.85 
 
 
226 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.54 
 
 
226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  60.35 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.3 
 
 
239 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.84 
 
 
232 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.41 
 
 
237 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  58.08 
 
 
238 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.84 
 
 
254 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.65 
 
 
238 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.77 
 
 
238 aa  254  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.49 
 
 
240 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.81 
 
 
236 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.21 
 
 
238 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  61.84 
 
 
254 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.8 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.44 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.46 
 
 
235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.73 
 
 
241 aa  251  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.58 
 
 
234 aa  251  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.94 
 
 
242 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.43 
 
 
236 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.38 
 
 
234 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.58 
 
 
235 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
263 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.19 
 
 
238 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.95 
 
 
242 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
234 aa  245  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.07 
 
 
232 aa  245  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.51 
 
 
230 aa  245  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.82 
 
 
239 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.25 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.82 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  52.84 
 
 
234 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.64 
 
 
238 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.59 
 
 
235 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  56.31 
 
 
237 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.59 
 
 
234 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  53.68 
 
 
232 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.68 
 
 
232 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.95 
 
 
238 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.82 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.22 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.07 
 
 
253 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  48.07 
 
 
253 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.62 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  48.25 
 
 
247 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  48.25 
 
 
247 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.1 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.12 
 
 
236 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.26 
 
 
244 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  41.26 
 
 
244 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  43.23 
 
 
230 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  42.67 
 
 
240 aa  178  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
245 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  42.79 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  42.98 
 
 
244 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  37.66 
 
 
232 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35.16 
 
 
240 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  36.75 
 
 
258 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.99 
 
 
242 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.44 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  34.8 
 
 
232 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  36.28 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
235 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  41.5 
 
 
276 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  36.19 
 
 
234 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  37.21 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  31.58 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  34.63 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  34.67 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  35.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 
646 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 
242 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  38.53 
 
 
243 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>