More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1754 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  98.74 
 
 
238 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  82.77 
 
 
238 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  80.97 
 
 
238 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  79.2 
 
 
238 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.67 
 
 
234 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  59.47 
 
 
263 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.47 
 
 
239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.47 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.81 
 
 
226 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.26 
 
 
226 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.81 
 
 
226 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.51 
 
 
238 aa  278  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.36 
 
 
226 aa  278  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  60.36 
 
 
226 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.36 
 
 
226 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.36 
 
 
226 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  60.36 
 
 
226 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.36 
 
 
226 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.56 
 
 
237 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  60.99 
 
 
234 aa  272  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
243 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.45 
 
 
230 aa  271  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.62 
 
 
234 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.44 
 
 
240 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.67 
 
 
241 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.18 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.11 
 
 
239 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  58.15 
 
 
232 aa  264  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.76 
 
 
235 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.08 
 
 
232 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.11 
 
 
235 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.83 
 
 
236 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.17 
 
 
235 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.27 
 
 
242 aa  258  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  57.89 
 
 
232 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.68 
 
 
227 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.39 
 
 
236 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.59 
 
 
234 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  59.21 
 
 
242 aa  254  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  58.85 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.59 
 
 
242 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
265 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
262 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
262 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
265 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
265 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.08 
 
 
240 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  60.71 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.82 
 
 
251 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.54 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 
231 aa  234  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.04 
 
 
235 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.39 
 
 
241 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.51 
 
 
234 aa  224  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.86 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  53.12 
 
 
232 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.12 
 
 
232 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.78 
 
 
238 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  46.64 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.98 
 
 
247 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.48 
 
 
244 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  44.8 
 
 
228 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.45 
 
 
253 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.45 
 
 
253 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  42.86 
 
 
240 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.6 
 
 
236 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.13 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
245 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  44.7 
 
 
247 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  44.7 
 
 
247 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  41.13 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  40.79 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.34 
 
 
236 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  39.44 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
224 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  38.21 
 
 
223 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  35.68 
 
 
230 aa  118  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
646 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.55 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  38.81 
 
 
655 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  37.73 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 
227 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  35.98 
 
 
242 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 
248 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  35.98 
 
 
242 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  36.28 
 
 
244 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  35.98 
 
 
242 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.36 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  36.45 
 
 
671 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  35.98 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  34.91 
 
 
224 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.85 
 
 
225 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  34.8 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>