More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3333 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3333  ATPase  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.27 
 
 		 230 aa  284  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  57.76 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  57.33 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.68 
 
 		 226 aa  279  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.52 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  63.23 
 
 		 226 aa  277  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  62.78 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.78 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  62.78 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.78 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.26 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.33 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.33 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.22 
 
 		 239 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.91 
 
 		 240 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  58.22 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.22 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.36 
 
 		 226 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.44 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.47 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.15 
 
 		 238 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.31 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  58.15 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.88 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  53.02 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.42 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.51 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.78 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.75 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.15 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.02 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.3 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.22 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  55.07 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.8 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.4 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  53.45 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.89 
 
 		 242 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.51 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.09 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.8 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.07 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.07 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.07 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.31 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.56 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.22 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.41 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.99 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.26 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.07 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.07 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.59 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  54.59 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  55.07 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.33 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.89 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  45.33 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  43.58 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  43.58 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  42.54 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.37 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  40.37 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  42.41 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.66 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.66 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  41.18 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  41.2 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  37.99 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  37.55 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  36.84 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  34.22 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3609  cell division ATP-binding protein FtsE  36.65 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3775  ABC transporter related  39.66 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  36.59 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  35.27 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>