More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0516 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  78.35 
 
 
239 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  78.35 
 
 
263 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  77.92 
 
 
239 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  77.38 
 
 
226 aa  352  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  75.11 
 
 
234 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  74.22 
 
 
240 aa  346  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  72.57 
 
 
237 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  344  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  73.09 
 
 
226 aa  344  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  344  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  73.09 
 
 
226 aa  344  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  344  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  343  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  343  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  73.09 
 
 
226 aa  343  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  68.89 
 
 
238 aa  334  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  68 
 
 
243 aa  328  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  62.22 
 
 
238 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.74 
 
 
238 aa  291  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.67 
 
 
238 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  62.67 
 
 
238 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  61.33 
 
 
238 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  59.74 
 
 
234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.67 
 
 
230 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  57.52 
 
 
232 aa  278  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.89 
 
 
232 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.66 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.75 
 
 
235 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 
235 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 
235 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.71 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  56.89 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  51.98 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  51.54 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.98 
 
 
242 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 
241 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.3 
 
 
227 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  54.55 
 
 
242 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.22 
 
 
251 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  54.87 
 
 
232 aa  242  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.87 
 
 
265 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.43 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.44 
 
 
234 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.43 
 
 
262 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.43 
 
 
262 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.88 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  49.78 
 
 
265 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.92 
 
 
231 aa  234  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  54.59 
 
 
254 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.6 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.78 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.04 
 
 
242 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.72 
 
 
235 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  53.39 
 
 
238 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.53 
 
 
232 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  52.53 
 
 
232 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.6 
 
 
238 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  50.67 
 
 
234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
245 aa  208  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  45.45 
 
 
240 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.78 
 
 
244 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.78 
 
 
244 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.21 
 
 
247 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  42.79 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.1 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  45.62 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  45.62 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.67 
 
 
236 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.81 
 
 
253 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.81 
 
 
253 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  43.27 
 
 
228 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  43.3 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  41.78 
 
 
232 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  38.83 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4467  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  36.79 
 
 
228 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  37.12 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  38.63 
 
 
241 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.1 
 
 
233 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.36 
 
 
238 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.32 
 
 
237 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  40.09 
 
 
236 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  39.35 
 
 
236 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  33.33 
 
 
242 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  39.57 
 
 
245 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  33.03 
 
 
226 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.47 
 
 
228 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  37.5 
 
 
229 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
226 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
226 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  37.23 
 
 
233 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
226 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  34.74 
 
 
259 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
226 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
226 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 
226 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  41.46 
 
 
230 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>