More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0140 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0140  phosphonate C-P lyase system, PhnL  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0761  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.35 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00513739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  61.01 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4191  ATPase  60.35 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0818  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  60.91 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3333  ATPase  55.75 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.48 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2191  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.26 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.63 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2256  ABC transporter  57.33 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.012889  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20420  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0618386  normal  0.588147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1754  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.89 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2564  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.89 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4433  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.17 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4094  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.11 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902785  normal  0.0383302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.39 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1281  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.56 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2881  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.56 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3830  phosphonate C-P lyase system, PhnL  55.56 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4337  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.26 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4119  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.99 
 
 		 235 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3698  phosphonate C-P lyase system, PhnL  56.25 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0484  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.5 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6093  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.65 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4562  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.34 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4650  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.34 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0580  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.41 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03968  carbon-phosphorus lyase complex subunit  57.34 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3895  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.34 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.34 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03928  hypothetical protein  57.34 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1311  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.04 
 
 		 242 aa  251  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0300  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  59.17 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.127563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5609  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.34 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0516  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.87 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2962  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.13 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3778  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.41 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1313  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.92 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2909  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.83 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5945  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  58.85 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.68977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0892  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.55 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.85 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3340  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.05 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1182  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3352  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2591  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0321  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3306  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  55.61 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5843  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding component, PhnL protein  54.22 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2184  ABC phophonate transporter, ATPase subunit PhnL  57.52 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4026  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  54.67 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3565  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.67 
 
 		 239 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  54.67 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3851  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.58 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2918  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  51.29 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0441964  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4777  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  57.21 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.21858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2283  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein PhnL  56.42 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.242881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1930  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  56.42 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.751332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2916  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  52.47 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5002  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.79 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3838  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.58 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.197211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3787  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  43.58 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0222  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.02 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4042  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  45.02 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2294  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  42.29 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4144  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  44.55 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0465  ABC type ATPase  45.97 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0429  ABC type ATPase  45.97 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3507  ABC transporter related  43.54 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2291  ABC phosphonate transport system ATPase  43.98 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1586  ABC transporter related  43.66 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3687  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2087  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0234  ABC transporter related  39.83 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  39.63 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.19 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  42.13 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  39.19 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  39.42 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  40.11 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  33.78 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  33.49 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>