150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2458 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 484 aa  1014    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133162  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.78 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.78 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.64 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  26.11 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  28.47 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  23.91 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.1 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.7 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.55 
 
 		 295 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.04 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  25.31 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  23.91 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  23.46 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.15 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.68 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  23.46 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  23.46 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.05 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.46 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.21 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  23.46 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  29.91 
 
 		 264 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  23.46 
 
 		 328 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.38 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.38 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.53 
 
 		 283 aa  55.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.66 
 
 		 267 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.97 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.03 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.56 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  24.68 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  22.38 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.1 
 
 		 271 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.48 
 
 		 281 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.82 
 
 		 291 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.03 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.96 
 
 		 313 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.04 
 
 		 288 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  23.44 
 
 		 313 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.44 
 
 		 313 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.37 
 
 		 282 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.31 
 
 		 312 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  23.29 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0111  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.03 
 
 		 269 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.53 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.5 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.86 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  23.72 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.67 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  27.56 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.77 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  24.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  22.89 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.32 
 
 		 294 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.29 
 
 		 305 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  20.65 
 
 		 285 aa  50.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0165  RimK domain-containing protein ATP-grasp  22.05 
 
 		 268 aa  50.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.364368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.87 
 
 		 267 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.16 
 
 		 285 aa  50.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  23.23 
 
 		 303 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.75 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.78 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  25.37 
 
 		 293 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  23.72 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.69 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  23.23 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  23.72 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  23.67 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.57 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  23.81 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  23.37 
 
 		 285 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.38 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 269 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  27.91 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  21.2 
 
 		 290 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  21.69 
 
 		 459 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  24.72 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.16 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25 
 
 		 327 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  21.92 
 
 		 281 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.56 
 
 		 269 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  22.83 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  23.67 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  24.84 
 
 		 267 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.2 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>