220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2691 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0111  RimK domain-containing protein ATP-grasp  50.57 
 
 		 269 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0165  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.25 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.364368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0076  RimK domain-containing protein ATP-grasp  51.57 
 
 		 272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.668019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.09 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  30.52 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.08 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.88 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.58 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.21 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.92 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.06 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.93 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.99 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  28.3 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  31.06 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  29.87 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  31.06 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.79 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.34 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  31.58 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  23.91 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133162  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.4 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  31.25 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  32.47 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  25.95 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  31.25 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.61 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  30.26 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  27.38 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  27.38 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.38 
 
 		 301 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  28.25 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  28.76 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  27.22 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  32.3 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.37 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.9 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  32.53 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  27.81 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.59 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.38 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  25.75 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.22 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.22 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.22 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.75 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.59 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.88 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  28.07 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  26.25 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  28 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.93 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.67 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.16 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.1 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.48 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  28.93 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.29 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.29 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.42 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  28.29 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.43 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  27.94 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  28.83 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.79 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.7 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  28.93 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.76 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.29 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  24.81 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>