242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3095 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0165  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.8 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.364368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0111  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.11 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  30.09 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0076  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.19 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.668019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0363  hypothetical protein  33.76 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.64 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133162  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  32.04 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.63 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  31.49 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  26.63 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  26.63 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.71 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  26.63 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.3 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  27.17 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.17 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  28.37 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  30.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  27.17 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  30.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  30.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  27.17 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  30.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  27.17 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  30.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  25.93 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.27 
 
 		 300 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.36 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.8 
 
 		 303 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.26 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  28.43 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  30.39 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  28.8 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.38 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  32.3 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.88 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  28.25 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  30.63 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  32.3 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.65 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.86 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  28.65 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.56 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  27.89 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.75 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.19 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.21 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.21 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.79 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.94 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  27.96 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.81 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.81 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.81 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  29.32 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  24.29 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  25.93 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.6 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  28.73 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.48 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  28.82 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  28.82 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  28.18 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.31 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  27.69 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  26.74 
 
 		 486 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.55 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.7 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  30.19 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.89 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  26.28 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.89 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  26.27 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.75 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  28.65 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  28.19 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.17 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.74 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  27.27 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.42 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.6 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  28.42 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  29.8 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  28.42 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>