78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0996 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  43.72 
 
 		 230 aa  188  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.67 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.92 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.3 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.86 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.46 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.8 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.13 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.8 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.91 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.98 
 
 		 243 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.51 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  40 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.64 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  36.61 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  30.63 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  30.18 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1333  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.89 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0130181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  31.11 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.23 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01438  Transcription negative regulator ChrR  30.08 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2935  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.59 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.714383  normal  0.0760187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2756  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.36 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1093  anti-sigma factor ChrR  29.82 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0365  anti-ECFsigma factor  30.59 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.931641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  29.09 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0090  anti sigma factor protein  29.52 
 
 		 230 aa  95.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0416  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.11 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3569  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0721  anti-Sigm factor, ChrR  28.18 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0517  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.05 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0550  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.55 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  27.11 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1618  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.58 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1042  transcriptional activator ChrR  24.07 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1960  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.07 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0408517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.19 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0891  transcriptional activator ChrR  26.24 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0487  anti-sigm factor, ChrR  27.15 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  25 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1630  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.69 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2958  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  32.63 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  23.36 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0275  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.98 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.26 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.21 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.29 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.34 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  32.05 
 
 		 114 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.25 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  44.9 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.35 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  33.71 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.17 
 
 		 117 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.17 
 
 		 117 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.8 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.07 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.07 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  38.33 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.07 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.79 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.29 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.66 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.03 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.85 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  30.21 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  35.59 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  35.59 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.34 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.79 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  34.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  30.14 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 230 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>