50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0517 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0517  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  39.01 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.04 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2756  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.8 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0550  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.94 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1093  anti-sigma factor ChrR  32.86 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0721  anti-Sigm factor, ChrR  33.03 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  33.64 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0090  anti sigma factor protein  33.33 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2935  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.02 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.714383  normal  0.0760187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  32.72 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0365  anti-ECFsigma factor  29.6 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.931641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0891  transcriptional activator ChrR  29.36 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1618  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.65 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  29.28 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1042  transcriptional activator ChrR  28.57 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0487  anti-sigm factor, ChrR  33.03 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0416  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.78 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3569  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.91 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2958  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1333  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.8 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0130181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.69 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  27.78 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.05 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.78 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  26.81 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1960  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.06 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0408517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.64 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  28.89 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.76 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.81 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.04 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.39 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.9 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1630  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.47 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.64 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  23.95 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.51 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.23 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.53 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  24.56 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.2 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01438  Transcription negative regulator ChrR  24.18 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0275  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.89 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.03 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.95 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  26.17 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  31 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>