More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1406 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  66.79 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  56.03 
 
 		 324 aa  316  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  55.32 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  56.68 
 
 		 334 aa  310  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  53.74 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 350 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  55.87 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  53.42 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  55.89 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  54.09 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  54.51 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  50.33 
 
 		 401 aa  291  9e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  54.09 
 
 		 326 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.88 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.39 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.39 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  50 
 
 		 413 aa  285  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  50.52 
 
 		 398 aa  281  8.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  51.59 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  48.48 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  48.15 
 
 		 395 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  51.93 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  55.95 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 340 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  48.42 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  51.72 
 
 		 328 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  48.26 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  48.26 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  50 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 329 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.7 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  50.9 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 330 aa  265  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 321 aa  265  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  47.93 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  47.69 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  49.32 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  50.34 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 289 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  51.75 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50.7 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  46.88 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.75 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  51.93 
 
 		 317 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 320 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>