More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0116 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  100 
 
 		 334 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  69.6 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  66.06 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  64.92 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  64.63 
 
 		 348 aa  427  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  59.27 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  59.57 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  60.26 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  58.36 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  56.83 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  59.06 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  55.03 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  56.88 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  56.68 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  54.42 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.22 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.22 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.19 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.68 
 
 		 298 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  54.32 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  50.85 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 287 aa  300  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 351 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  51.57 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.29 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  51.57 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  49.33 
 
 		 413 aa  294  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 298 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 298 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 299 aa  292  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  50.17 
 
 		 398 aa  291  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  54.48 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  52.03 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  52.1 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  48.42 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 316 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.3 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.71 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  52.27 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  47.84 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 290 aa  284  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  47.44 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  47.78 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  47.78 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 323 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>