More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2102 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  98.77 
 
 
326 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  100 
 
 
326 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  97.55 
 
 
326 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  86.55 
 
 
294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  59.66 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  57.44 
 
 
335 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  53.61 
 
 
413 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  55.86 
 
 
328 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  48.82 
 
 
401 aa  327  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  55.94 
 
 
368 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  55.44 
 
 
348 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  53.42 
 
 
399 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  54.9 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  54.93 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  51.38 
 
 
398 aa  318  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  55.03 
 
 
334 aa  318  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  56.36 
 
 
324 aa  317  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  52.67 
 
 
314 aa  315  8e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  55.44 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  52.54 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  54.01 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  54.23 
 
 
329 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  53.87 
 
 
329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  55.23 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.02 
 
 
283 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  53.42 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  56.79 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  53.42 
 
 
320 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  51.8 
 
 
285 aa  297  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  51.75 
 
 
312 aa  296  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52.71 
 
 
282 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.62 
 
 
309 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  54.09 
 
 
291 aa  291  9e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  51.09 
 
 
291 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  50.7 
 
 
338 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  50.7 
 
 
338 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  50.7 
 
 
338 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  52.48 
 
 
315 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  50.7 
 
 
338 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.62 
 
 
308 aa  288  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  51.25 
 
 
318 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  52.5 
 
 
312 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.62 
 
 
355 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  51.01 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  49.47 
 
 
325 aa  285  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  52.35 
 
 
324 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  49.83 
 
 
310 aa  285  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  50.9 
 
 
335 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.24 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  50.18 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.65 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  49.82 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  49.82 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  49.82 
 
 
325 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  48.41 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  51.06 
 
 
330 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52 
 
 
303 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52 
 
 
303 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
318 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  47.65 
 
 
334 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.11 
 
 
297 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.7 
 
 
335 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.25 
 
 
320 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.75 
 
 
299 aa  279  6e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  49.28 
 
 
282 aa  278  8e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  50.18 
 
 
336 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.9 
 
 
337 aa  278  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  51.08 
 
 
334 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  50 
 
 
326 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  52.14 
 
 
317 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  49.24 
 
 
280 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  50 
 
 
326 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  52.14 
 
 
317 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  49.65 
 
 
311 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  48.2 
 
 
314 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  50 
 
 
332 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  49.82 
 
 
319 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50 
 
 
318 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50 
 
 
339 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  50.35 
 
 
306 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.57 
 
 
337 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>