More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0672 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  83.44 
 
 
311 aa  527  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  81.52 
 
 
312 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  78.66 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  77.88 
 
 
321 aa  486  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  57.93 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  54.93 
 
 
401 aa  325  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  54.88 
 
 
294 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  54.98 
 
 
413 aa  322  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  55.33 
 
 
398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  54.24 
 
 
395 aa  318  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  54.36 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  54.01 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  54.01 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  53.54 
 
 
368 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  53.33 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  51.67 
 
 
348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  55.17 
 
 
324 aa  308  8e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  54.01 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  55.4 
 
 
331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  53.66 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  52.46 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  52.17 
 
 
335 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  52.76 
 
 
324 aa  291  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  52.03 
 
 
334 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.51 
 
 
328 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.3 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.39 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.78 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  48.39 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  51.04 
 
 
329 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  51.39 
 
 
335 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  51.89 
 
 
334 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.62 
 
 
299 aa  278  6e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  51.2 
 
 
334 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  50.35 
 
 
306 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  47.84 
 
 
288 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.35 
 
 
297 aa  277  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  46.38 
 
 
311 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.41 
 
 
299 aa  276  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  48.08 
 
 
304 aa  275  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  50 
 
 
332 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.18 
 
 
321 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.53 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  49.13 
 
 
291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  50.7 
 
 
355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  46.4 
 
 
290 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  51.6 
 
 
325 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  47.57 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.5 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  48.59 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  50.51 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.17 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  50.53 
 
 
327 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.17 
 
 
325 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  49.82 
 
 
307 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  50.53 
 
 
323 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.29 
 
 
314 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  49.26 
 
 
285 aa  270  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.25 
 
 
303 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.25 
 
 
303 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.89 
 
 
308 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  50 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  48.32 
 
 
332 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.77 
 
 
321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  50 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  50 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  50 
 
 
338 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  50 
 
 
326 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.04 
 
 
305 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.04 
 
 
305 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  50 
 
 
326 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  48.04 
 
 
282 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  49.82 
 
 
319 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.24 
 
 
298 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
318 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  50.53 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.16 
 
 
298 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  48.32 
 
 
311 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.81 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  49.82 
 
 
315 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.15 
 
 
322 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  49.3 
 
 
332 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  44.64 
 
 
312 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.81 
 
 
298 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  49.82 
 
 
315 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>