More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2099 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  100 
 
 
312 aa  637    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  82.99 
 
 
308 aa  497  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  77.15 
 
 
311 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  75.32 
 
 
321 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  75.24 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  54.05 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  53.51 
 
 
399 aa  319  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  54.7 
 
 
413 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  53.18 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  55.44 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  50.8 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  51.14 
 
 
401 aa  305  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  54.74 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  53.1 
 
 
294 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  51.75 
 
 
326 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  51.75 
 
 
326 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  51.75 
 
 
326 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  51.06 
 
 
350 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  52.26 
 
 
368 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  51.41 
 
 
329 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  51.06 
 
 
329 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  50.87 
 
 
324 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  51.21 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  49.47 
 
 
348 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.17 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  52.13 
 
 
334 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.3 
 
 
283 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.56 
 
 
288 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.89 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.24 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.56 
 
 
321 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.82 
 
 
321 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  50.88 
 
 
318 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  47.12 
 
 
299 aa  271  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.84 
 
 
290 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  44.81 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.15 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.48 
 
 
338 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  49.48 
 
 
338 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  51.25 
 
 
325 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  49.48 
 
 
338 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.71 
 
 
335 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  49.48 
 
 
338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.02 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.39 
 
 
351 aa  268  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.14 
 
 
304 aa  268  8e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.17 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.17 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  50.18 
 
 
335 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  51.25 
 
 
324 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  50.35 
 
 
334 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  50.18 
 
 
327 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  50.18 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.35 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  46.43 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  48.06 
 
 
328 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  49.13 
 
 
333 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  47.52 
 
 
298 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  48.42 
 
 
306 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  48.79 
 
 
333 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.95 
 
 
304 aa  265  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.39 
 
 
298 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  49.65 
 
 
334 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  46.44 
 
 
299 aa  263  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  45.7 
 
 
312 aa  263  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  46.29 
 
 
298 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.11 
 
 
355 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  44.22 
 
 
311 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  44.29 
 
 
292 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  46.28 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  46.28 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  47.62 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  48.1 
 
 
291 aa  262  6e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.52 
 
 
302 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  48.1 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.75 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>