More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0513 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  72.3 
 
 		 304 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  70 
 
 		 290 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  66.33 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  66.78 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  64.24 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  66.06 
 
 		 299 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  65.58 
 
 		 290 aa  384  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  60.41 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.26 
 
 		 298 aa  338  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.84 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  55.6 
 
 		 282 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  52.61 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  52.61 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.92 
 
 		 298 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.45 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.57 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.26 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.7 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  50 
 
 		 324 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  52.14 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 338 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 338 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 340 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 323 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 300 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  47.24 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  47.24 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 298 aa  291  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  47.93 
 
 		 318 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  48.97 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  52.52 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 334 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  44.83 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 348 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 351 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 350 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  48.33 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  47 
 
 		 288 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 325 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  47.78 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.69 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  46.95 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  47.75 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  46.34 
 
 		 326 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.18 
 
 		 318 aa  281  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  46.34 
 
 		 326 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  47.99 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  47.2 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>