More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2195 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  100 
 
 		 328 aa  672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  58.64 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  59.67 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  59.39 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  60.41 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  59.03 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  56.36 
 
 		 290 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  57.71 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  59.6 
 
 		 321 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 288 aa  348  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  59.65 
 
 		 298 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  59.78 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  60.07 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  58.51 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  55.76 
 
 		 298 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  58.12 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  53 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  53 
 
 		 338 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  53 
 
 		 338 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  53 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  57.04 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  57.04 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  56.93 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  52.65 
 
 		 323 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  52.3 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  57.55 
 
 		 300 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  56.93 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  56 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  51.71 
 
 		 335 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  52.65 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  54.06 
 
 		 298 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  51.76 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  54.91 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  53.71 
 
 		 298 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  53.55 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  51.38 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.58 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  54.71 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.58 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  55.59 
 
 		 296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.25 
 
 		 318 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  54.18 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  54.01 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  53.11 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 329 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 317 aa  301  7.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 334 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  53.76 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  52.36 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  54.38 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  52.19 
 
 		 299 aa  299  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.17 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  55.56 
 
 		 276 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>