More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4853 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  99.41 
 
 		 338 aa  695    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  99.41 
 
 		 338 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  99.41 
 
 		 338 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  100 
 
 		 338 aa  698    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  90.15 
 
 		 335 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  88.79 
 
 		 340 aa  624  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  92.36 
 
 		 323 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  92.36 
 
 		 327 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  92.99 
 
 		 318 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  87.9 
 
 		 325 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  84.91 
 
 		 324 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  65.99 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  69.9 
 
 		 319 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  71.61 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  69.16 
 
 		 327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  66.46 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  68.77 
 
 		 318 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  68.61 
 
 		 315 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  66.46 
 
 		 333 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  66.88 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  65.23 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  65.72 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  68.51 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  65.02 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  65.64 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  68.83 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  68.83 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  67.86 
 
 		 332 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  65.72 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  67.96 
 
 		 332 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  66.88 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  64.47 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  65.09 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  66.24 
 
 		 330 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  65.83 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  64.47 
 
 		 321 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  66.56 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  65.11 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  64.47 
 
 		 321 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  66.56 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  66.56 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  66.56 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  65.09 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  64.78 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  64.47 
 
 		 321 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  66.56 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  63.84 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  64.67 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  64.15 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  63.84 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  64.15 
 
 		 321 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  66.23 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  65.59 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  66.78 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  64.47 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  63.84 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  64.15 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  61.16 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  65.91 
 
 		 330 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  61.93 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  63.21 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  63.84 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  62.58 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  65.4 
 
 		 324 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1668  lipoyl synthase  64.44 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.826169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  62.89 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  65.3 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  62.89 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  61.3 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  65.55 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  62.89 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  61.3 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  62.89 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  63.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  61.95 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  66.78 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>